Saludos!

Hasta el momento, califico mi trabajo de investigacion en la escala 4, hemos logrado mucho progreso logrando al menos el 80% de mis objetivos. La razon por la cual no pongo un 100% es que aun no hemos logrado conseguir el “kit” para medir nutrientes. Esta la unica dificultad que hemos presentado al momento. Este asunto sera solucionado el siguiente mes ya que se va a mandar a comprar.

Abstract – Mi trabajo de investigacion – Microbiologia

 

R.A.F. Romanelli, G. O. Diaz, F.A. Castrodad, University of Puerto Rico-Humacao, Biology department.

 

Title

Diversity and spatial distribution of Navicula sp. and Pinnularia sp. in the pond of the forest of the University of Puerto Rico at Humacao

 

Abstract

In the forest of the University of Puerto Rico at Humacao there is a pond of approximately 77.17meters in diameter and a mean depth of 0.4 meters. This pond has a heterogeneous population of microalgae, in which the most frequently found algae are the ones of the genres: Navicula and Pinnularia. In 2006, we began studies of diversity that have let us established the different populations allocated there. The technique we used in our laboratory for the characterization of microalgae was light microscopy of in-vivo samples taken and analyzed periodically. While determining the pond’s composition we compared the samples with images found on the literature and different data bases. The study of the population dynamics of the pond was focused on the presence of Navicula sp. and Pinnularia sp. due to the relative abundance of them. We have observed correlations between the population dynamics of these microalgae and the volume and other abiotic factors affecting the pond.

Saludos a todos!!! Espero que se encuentren muy bien y que sus investigaciones esten rindiendo fruto!

Primero, quisiera agradecerle al programa Biominds por tan excelente actividad en el Annual poster day. Es mi orgullo decir que fui participe de tan enriquecedora actividad. En la misma evalue los siguientes trabajos:

Development of a biosensor using Hbl of Lucina pectinata with purification methods and characterization by electroanalytical technique

por: Leisha Cruz – UPRM

En este proyecto se propuso investigar las propiedades electroquimicas de la proteina Hbl con el proposito de utilizar dicha proteina como un biosensor con el proposito de detectar la presencia de H2S. La voltimetria es un metodo electroquimico utilizado en el analisis quimico y de esa manera ayudar en el estudio de propiedades electroquimicas en diferentes biomateriales. Este metodo se utilizo para medir la cinetica en la transferencia de electrones en 4 proteinas diferentes: Cytochrome-c, hemoglobina, mioglobina y Hbl mediante el uso de un electrodo GC. Durante el trabajo se reporto metodos de purificacion para el electrodo recombinante Hbl y Hbl/Sol-gel (TMOS(tetramethyl orthosilicate)), arreglado por interacciones intermoleculares de hemoglobina I recombinante de Lucina pectinata y TMOS en un electrodo de pasta de carbon. El espectro UV-Vis revelo que la proteina esta altamente purificada, mostrando bandas para dos especies de hemoglobina. Los resultados del trabajo sugieren que el proceso redox fue controlado en absorcion y la hemoglobina inmovilizada fue estable.

Synthesis of new platinum complexes of the type cis-[PtCl2(NH3)(L)] with thiazoles

por: Magdelisse Velazquez Repollet – UPRM

Los complejos de platino se han reconocido por su actividad para combatir el cancer. Cisplatin es el mas utilizado en este grupo. El unico problema con este es que produce ciertos efectos secundarios indeseables y un espectro de actividad limitado. El proposito principal de este proyecto es preparar complejos del tipo cis–[PtCl2(NH3)(L)] en donde se reemplazen los atomos de hidrogeno por grupos metil en el ligando thiazole. Con esto se espera que la droga sea una mucho mas estable impidiendo estericamente el acercamiento del atomo Pt. Los estudios de espectro demostraron que la sintesis fue exitosa, y el producto contiene principalmente el complejo deseado: cis-[PtCl2(NH3)(thiazole)]. Como trabajo aun en progreso, se encuentran la sintesis de nuevos complejos de derivados methyl de thiazole.

Rubia tinctorum as effective phytoremediator of soils contaminated with cadmium

por: Sorivette Surillo – UPRM

Al referirnos a phytoremediacion, nos referimos al uso de plantas como agentes limpiadores de suelos contaminados con polutos. Los suelos estan contaminados en ocasiones por metales pesados por el uso y la construccion de explosivos, pesticidas o quimicos industriales. El cadmio es un agente dificil de remover del suelo y de lenta ocurrencia. Uno de los objetivos principales de este proyecto es investigar sobre la resistencia al cadmio y la capacidad de acumulacion de Rubia tinctorum. Los resultados del proyecto al momento, reflejan que los clones de Rubia utilizados son ambos resistentes al cadmio y capaces de acumularlo. Los resultados del proyecto sugieren que la planta es capaz de absorber el cadmio del medio. Tambien se observo que el medio cambia de color en una variedad de colores desde el rojo al anaranjado dependiendo del cadmio inicial.

Siendo este mi ultima entrada al blog como parte del programa Biominds, quisiera agradecerle al programa por todo lo que me ayudaron para poder hacer posible mi experiencia de investigacion. Siempre estare eternamente agradecido por la gran oportunidad que me brindaron y sera mi meta pagarles con mi exito academico y profesional futuro.

A mis companeros del programa Biominds que compartieron esta tarea conmigo, les deseo todo lo mejor del mundo y que todas sus metas puedan ser cumplidas.

Hola!!

Saludos a todos y bienvenidos a este nuevo semestre academico y de investigacion!!

Al final de este semestre esperamos haber podido completar un perfil de profundidad de la charca de estudio en donde se incluya la profundidad en al menos 3 lugares determinados de la misma. Esto se hara para tener una dia mas clara de la relacion de los datos recopilados con el volumen y expansion de agua de la charca.  Aparte se planea comenzar a medir las cantidades de nutrientes en la charca tomando en cuenta niveles de fosfato y parafosfato, los cuales se compararan con datos de silica presente en el agua. Esta seria una tecnica que planeamos incluir en nuestro proyecto este semestre. Similar al trabajo del semestre pasado se estara tomando muestra semanalmente la cual se estara centrifugando para luego analizarla, tecnica que se implanto desde el semestre pasado.

Con los datos que se recopilen durante este semestre esperamos poder sustentar nuestros pasados datos y conclusiones con resultados mas precisos, al tener el perfil de la charca y medir los niveles de nutrientes y abundancia de silica para asi probar la presencia masiva de las especies que se han determinado son las mas abundantes de la charca, las cuales son diatomeas.

Durante este semestre se propuso lograr obtener mas data para confirmar o descartar pasadas premisas propuestas. Se ha podido notar con claridad que las algas mas abundantes son las anteriormente propuestas; las algas de los generos Navicula y Pinnularia. Entre ambos generos, el de mayor predominancia durante los muestreos realizados durante este semestre lo fue Navicula. Esto es un resultado contrario a los encontrados anteriormente en donde en los meses de Agosto a Diciembre donde hay mayor precipitacion (este semestre no fue la excepcion), el alga predominante lo era Pinnularia. Entre los resultados de los pasados muestreos, Navicula demostro predominancia en 7 ocasiones mostro una predominancia de mas de 65% con relacion a Pinnularia. Solo en una ocasion se mostro una predominancia de tan solo un 54%. Se mostro una abundancia considerable de un alga que anterior a practicar esta tecnica no se habia considerado su abundancia, y esta es la del genero Phacus. En conclusion, esta nueva tecnica ha traido nuevos datos a nuestra investigacion. De hecho, desde su aplicacion la obtencion de datos ha aumentado significativamente. Esto puede deberse a que al anexar todo en un “pellet” se puede tener una vision mas amplia del contenido de la muestra. Al no hacerlo, durante el analisis microscopico de la muestra puede perderse de perspectiva la abundancia de ciertos organismos. Durante el semestre que viene, los planes son continuar realizando los conteos de organismos como lo hemos hecho hasta el momento, utilizando la tecnica de centrufugacion de las muestras. Se espera completar con un ciclo de 2 anos de tabulacion de datos de dinamica poblacional, y con estos presentar nuestro trabajo a fin de ano academico. Durante los siguientes muestreos se va a investigar la presencia de algas del genero Phacus, y se investigara su efecto en la dinamica poblacional de la charca con relacion a las algas de los generos Navicula y Pinnularia.

Saludos! Al momento considero he logrado alcanzar el numero 4 en la escala; he logrado al menos el 80% de mis objetivos. Hemos podido confirmar con mayor data la premisa que habiamos presentado anteriormente en cuanto a los grupos de mayor predominancia en la charca, los cuales son las microalgas de los generos Navicula y Pinnularia. Esto lo logramos al tratar una tecnica nueva propuesta por un companero en el laboratorio. Esta consiste en centrifugar muestras de agua de 250ml, a 2,500 revoluciones por 5 minutos. De esta manera, se aplica una velocidad considerable que permite la formacion de un “pellet” pero a la misma vez no se ven afectados los microorganismos.

En datos de semestres anteriores se ha notado que en los meses de Agosto a Diciembre hay mayor precipitacion que en los meses de Enero a Mayo. Esto hace que durante Agosto a Diciembre la charca muestre un patron de mayor predominancia de algas del genero Pinnularia. Esto no se observo durante los ultimos muestreos, maxime al centrifugar las muestras. Al hacer esto, la predominancia de Navicula fue notable, alcanzando un 67% en abundancia con relacion a Pinnularia.

Saludos a todos!!!

Califico mi progreso hasta el momento en la categoria 3. Progreso intermedio, ya que a pesar de que se ha logrado seguir tomando y analizando muestras con la acostumbrada frecuencia, hemos tenido dificultades accediendo el area de recogido de muestra. Esto ya que recursos fisicos de la unicversidad nos ha arrojado algo de basura en las inmediaciones. Este problema se estara resolviendo en las proximas semanas.

Saludos y bienvenidos sean todos a este nuevo semestre!!!

Para comenzar, nuestra propuesta investigativa de este semestre consiste de llevar nuestro analisis de dinamica poblacional a un nivel mas especifico a nivel de composicion quimica. Anteriormente habiamos basado los conteos a un plano visual utilizando un hemocitometro para contar cantidad de celulas. Durante este semestre comenzaremos a medir los niveles de nutrientes en el agua (fosfato, ortofosfato, etc.) y los niveles de silica, para de esta manera tener una cuantificacion a nivel quimico aun mas especifica. Ambos parametros seran analizados y comparados con los parametros fisicos del ambiente para establecer datos sobre la dinamica poblacional de las algas en la charca.

 Al finalizar este semestre esperamos haber cuantificado diferentes muestras a nivel quimico las cuales nos provean datos mas especificos sobre la dinamica poblacional de la charca. Esperamos poder notar datos que correlacionen con los ya obtenidos para ayudar a corroborar los mismos. Esperamos poder perfeccionar esta tecnica, para que nos sirva de ayuda no solo a nosotros sino a demas investigadores interesados en trabajar en esta area.

 Basicamente, estos conteos son bastante parecidos a los de semestres anteriores con la unica diferencia de que estos tienen como proposito obtener un mayor nivel de especificidad en los mismos.

Recientemente he estado visitando diferentes bio-blogs de otros compañeros del programa y realemente ha sido una experiencia muy enriquecedora. He podido constatar la gran diversidad de diferentes campos de la ciencia que estan siendo impactados con la ayuda del programa Bio-Minds. De veras me enorgullese pertenecer a un programa tan diverso del cual espero aprender cada dia mas. Quiero que llegue el dia del simposio de Bio-Minds y asi ver el progreso del trabajo de investigacion de mis compañeros. Al pasar por los Bio-Blogs he aprendido sobre tecnicas, y diferentes areas de investigacion de las cuales desconocia se investigaba en la UPR. Al ver mi trabajo y el de mis compañeros, me doy cuenta lo mucho que pueden ayudar programas como Bio-minds por lo que me siento muy orgulloso de pertenecer al mismo.

Este ha sido un semestre de arduo trabajo pero sobre todo mucha satisfaccion. Con los datos recopilados durante este semestre gracias a la ayuda del programa BIO-MINDS, ademas de los datos recopilados previamente, logre presentar mi trabajo de investigacion en el Seminario de Flora y Fauna del Caribe celebrado el 25/Abril/2008. Fue de gran satisfaccion para mi poder presentar los datos y difundir el conocimiento adquirido hasta el momento como parte de mi investigacion y asi contribuir con la comunidad cientifica que es lo que finalmente como cientificos nos proponemos desde el inicio. He aprendido mucho durante el semestre en cuanto a como perfeccionar tecnicas para una mejor obtencion de datos. El reforzado mi capacidad para trabajar en equipo enormemente. Mas que nada, he aprendido sobre como preparar un articulo cientifico y como plasmarlo en un afiche para presentarlo en un simposio. Aprendi mucho en el proceso de la preparacion del afiche para el simposio asi como tambien de la experiencia de presentar mi trabajo de investigacion en un simposio cientifico.

Debo decir que fue una enorme satisfaccion poder ver que mi trabajo de investigacion esta rindiendo fruto y que tengo mucho que hacer por delante. Esta ha sido una gran experiencia para mi por lo cual exhorto a todos mis compañeros de BIO-MINDS que si no han tenido esta experiencia aun, trabajen fuerte para poder conseguir presentar sus trabajos de investigacion. Sera una experiencia unica y de mucho crecimiento. Con el trabajo en equipo y el excelente acesoramiento y apoyo incondicional que he recibido de mi mentor, he logrado sobrepasar barreras y sobre todo mis espectativas acerca de todo lo que puedo lograr en este campo de la ciencia.

He recibido buenas recomendaciones de especialistas en mi campo de investigacion por lo que estare llevando a cabo ciertas tecnicas y experimentos adicionales durante el proximo semestre. Estare llevando a cabo pruebas para medir niveles de nutrientes en el agua, especialmente los niveles de nitrogeno y ortofosfato. Tambien estare midiendo la cantidad de silica en el agua (componente de pared celular de algas), de esta manera podre cuantificar y contrastar la abundancia de algas en la charca, con los niveles de nutrientes en el agua y poder observar cual presenta ser el nutriente limitante en el agua.